筌者所以在鱼，得鱼而忘筌；言者所以在意，得意而忘言

本文面向Tanglab及类似的需要使用Linux、但缺乏相关基础的科研人士

本文基于《TLCL 快乐的 Linux 命令行》 ，计划每周给实验室同学普及一些linux常识。如果你希望深入学习，应当阅读原文。

如果你拥有丰富的经验，基础内容对你的帮助可能比较有限，但扩展内容应该能给你一些有益的启发。

“Markdown” is two things:

(1) a plain text formatting syntax;

(2) a software tool, that converts the plain text formatting to others.

为什么要学习Markdown？

虽然你不一定能够感觉到，但是markdown已经存在于你的身边：

1. 它可以记录笔记，比如本文就是用markdown写作的
2. 每天阅读的BLOG，文档，下载包中的README.md，乃至微信公众号——他们可能都是基于markdown写作的
3. MARKDOWN可以大大减少重复性、对个人提升毫无帮助的工作——让你离开一遍又一遍的统一格式、版本管理、手动存储和笔记备注，把更多的精力放在创造性的工作之上——如果说互联网是当代生产力的基础，那markdown就是当代互联网的基础。

基于NMRPipe的RDC数据处理教程

0. 预备知识

残余偶极耦合（Residual Dipolar Coupling，RDC）是一种基于核磁共振的表征手段，常用于蛋白质动态结构的辅助解析与验证，其原理为：空间上相互邻近，但不具备化学键连的偶极（如^1^H-^15^N原子对）之间，存在直接的电磁相互作用，在溶液中，偶极朝不同方向的分布相同，因而偶极-偶极相互作用平均值为零，无法直接观测；而在液晶或聚合物孔洞等定向程度高的环境，偶极朝不同方向的分布有差异，因此偶极-偶极相互作用平均值不为零（这是“残余（剩余）”一词的由来），表现为J耦合形成的裂分进一步增大或减小，其大小与偶极间的相对朝向有关，故可用于获取化学键的空间取向，以修正蛋白质结构。

为了鼓励大家锻炼身体，唐老师组织TangLab成员每周五下午5:00-6:00进行羽毛球活动。2022年7月8日进行了第一次羽毛球活动，虽然大部分同学接触羽毛球不多，但都热情十足，在锻炼中收获了快乐。相信大家的体质和羽毛球水平会在今后的活动中，逐步提高。

2022年4月27日，TangLab于颐和园进行了踏春活动。

2022年1月20日，TangLab于北京大学中关新园康乐中心保龄球馆进行了新年活动——体验保龄球。

Yunli Zhao(赵云丽)

纽约州立大学石溪分校的汪劲教授于北京时间2021年12月9日，受唐淳老师邀来北京大学化学与分子工程学院作《蛋白质折叠和结合以及染色体动力学的能量景观》报告。

Tuturial for running Alphafold on Tanglab.pku.edu.cn

Query

alphafold vs standard structure